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1993年,法学专业脱离社会科学学院而成为独立的法学院。1994年,哥本哈根大学开设环境科学、南北关系和生物工艺学等新专业,并在政策上给予倾斜,以适应其长期发展的需要。从1996年开始,哥本哈根大学又陆续建造了一些新的建筑,包括阿迈厄岛(Amager)上的生物技术中心和人文学院大楼(今South Campus)。

1997年,哥本哈根大学与西兰岛上的其他丹麦高校,以及厄勒海峡彼端的瑞典高等教育机构加强联系,形成了信息互通、资源共享的学术共同体(?resund University),哥本哈根大学和隆德大学设立了秘书处。

随着厄勒海峡大桥的开通,两岸交流更是日益频繁,一跃成为北欧最具科研创新活力的地区(?resund Science Region)。

21世纪初,学校有超过3万7千多名学生和7千多名职工,成为全国最大的教学机构。2006年,学校宣布开始逐渐撤离拥有超过五百年历史的哥本哈根内城古教学建筑,对日益增多的院系部门进行集中化,以便形成更大、更现代化的校区和加强跨学科合作。

2007年,因合并皇家兽医和农业大学和丹麦的皇家药大学,哥本哈根大学纳入了两个新学院:生命科学学院和医药科学学院。生命科学学院和医药科学学院的生命科学、药学科学联同卫生科学,使其成为北欧最大的健康和生命科学中心之一。

2012年,医药科学学院、卫生科学学院、三分之一的生命科学学院合并为医药与健康科学学院,剩下三分之二的生命科学学院并入自然科学学院。至此,六大院系形成。

2013年4月,皇家图书情报学院(The Royal School of Library and Information Science)[12]正式并入人文学院。

在位于Frue Plads的古老的大学主楼的正门之上,栖着一鹰,其下就是哥本哈根大学的校训。原文为拉丁文“Coelestem adspicit lucem”(全句为“Sublimia petens ingenium/ Coelestem adspicit lucem”)。丹麦文为“Den ?jner det himmelske lys“。

英文为“It beholds the celestial light”。

关于其中的“It”,有两种说法,一说猜测其为北欧神话中的维德佛尔尼尔,见证哥本哈根大学洞彻天际的智慧之光;另一说则出自彼时在哥本哈根大学同时攻读文学与自然科学学位的冰岛诗人 Jónas Hallgrímsson 的诗 Hornbjarg (“Horn Crag”),诗中的鹰是柏拉图等思想者之沉思——或者更广泛地说,人类之精神——的意象:鹰注视着天光的尽头,因其不惧阳光,而目光锐利;意指只有志存高远,不畏艰险,洞烛幽微,方能接近真理。

此校训译成中文为“目之所及,天光妙契”。

1728年10月,哥本哈根发生持续4天的大火,近三成的城市建筑被烧毁,二成的城市人口无家可归。

火灾亦使哥本哈根大学图书馆毁于一旦,近4万册图书付之一炬,其中大量是中世纪留存下来的珍本和孤本;哥本哈根大学天文台的观测设备和观测记录也被烧毁。

不过,学校幸免于1795年的大火。

虽然学校在1801年的哥本哈根战役[Battle of Copenhagen (1801)]中未受波及,但地质博物馆在1807年英国和丹麦的交战[Battle of Copenhagen (1807)中被毁,当时英国的舰队炮轰哥本哈根城(Bombardment of Copenhagen),哥本哈根大学超过一半的古老建筑在这次战役中被毁。

1836年,新的大学主楼落成[18]。哥本哈根大学的很多附属机构,包括图书馆、动物学博物馆、地质博物馆、植物园和温室等都是在这段时间内建立起来的。

进入20世纪,哥本哈根大学把发展转向哥本哈根市的北部,在那Botanical Garden里成立新的大学医院、新的图书馆、理论物理中心、自然科学中心。

哥本哈根大学现有许多博物馆、博物园,如动物学博物馆、植物园和温室、地质学博物馆、医学博物馆等。

地质博物馆现藏有800多万种样品;植物园则最大规模地收集了现存植物种类,拥有全球三万多种植物,并拥有三个基因库。

哥本哈根大学图书馆现已并入丹麦皇家图书馆(The Royal Library, The National Library of Denmark and Copenhagen University Library)[19],是北欧地区最大的图书馆。

哥本哈根大学的最高管理机构是校务委员会,委员会成员由学生、教师、管理和技术人员三部分组成。

教师主要分为荣休教授、教授、副教授和助理教授等;此外还有客座教授、资深顾问,以及特聘的专家导师和学术雇员等。学校不拘一格聘用人才,但仍需遵循丹麦政府的一系列规定,以确保学生获得最高质量的国际认证教学。

2014年学校有职工一万多人,其中教师超过一半;同期在校学生人数超过四万人,其中本科生两万三千多人,硕士和博士两万多人;此外还有国际学生近四千人。

大学的经费主要来自国家的直接拨款。1999年的年度预算是24.2亿丹麦克郎,其中有大约4亿克郎的资助来自国家科学研究委员会、国际组织以及私人基金和公司。

2010年大学预算超过10亿欧元,为全欧第四,仅次于Oxbridge和苏黎世联邦理工学院。

丹麦人口仅500多万,不到英国的十分之一、美国的百分之二、中国的千分之五,而她在各领域或培养或吸引的杰出人物却是灿若繁星,这其中哥本哈根大学厥功至伟。

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